Get residue positions
get_residue_positions.RdGet residue positions
Arguments
- dat
data imported by the
read_hdxfunction.
Details
Prepares data table for high-resoultion values. It creates a long data frame with each position in the sequence accompanied by the amino acid placed in this position.
Examples
get_residue_positions(alpha_dat)
#> position aa
#> 1 1 G
#> 2 2 F
#> 3 3 G
#> 4 4 D
#> 5 5 L
#> 6 6 K
#> 7 7 S
#> 8 8 P
#> 9 9 A
#> 10 10 G
#> 11 11 L
#> 12 12 Q
#> 13 13 V
#> 14 14 L
#> 15 15 N
#> 16 16 D
#> 17 17 Y
#> 18 18 L
#> 19 19 A
#> 20 20 D
#> 21 21 K
#> 22 22 S
#> 23 23 Y
#> 24 24 I
#> 25 25 E
#> 26 26 G
#> 27 27 Y
#> 28 28 V
#> 29 29 P
#> 30 30 S
#> 31 31 Q
#> 32 32 A
#> 33 33 D
#> 34 34 V
#> 35 35 A
#> 36 36 V
#> 37 37 F
#> 38 38 E
#> 39 39 A
#> 40 40 V
#> 41 41 S
#> 42 42 S
#> 43 43 P
#> 44 44 P
#> 45 45 P
#> 46 46 A
#> 47 47 D
#> 48 48 L
#> 49 49 C
#> 50 50 H
#> 51 51 A
#> 52 52 L
#> 53 53 R
#> 54 54 W
#> 55 55 Y
#> 56 56 N
#> 57 57 H
#> 58 58 I
#> 59 59 K
#> 60 60 S
#> 61 61 Y
#> 62 62 E
#> 63 63 K
#> 64 64 E
#> 65 65 K
#> 66 66 A
#> 67 67 S
#> 68 68 L
#> 69 69 P
#> 70 70 G
#> 71 71 V
#> 72 72 K
#> 73 73 K
#> 74 74 A
#> 75 75 L
#> 76 76 G
#> 77 77 K
#> 78 78 Y
#> 79 79 G
#> 80 80 P
#> 81 81 A
#> 82 82 D
#> 83 83 V
#> 84 84 E
#> 85 85 D
#> 86 86 T
#> 87 87 T
#> 88 88 G
#> 89 89 S
#> 90 90 G
#> 91 91 A
#> 92 92 T
#> 93 93 D
#> 94 94 S
#> 95 95 K
#> 96 96 D
#> 97 97 D
#> 98 98 D
#> 99 99 D
#> 100 100 I
#> 101 101 D
#> 102 102 L
#> 103 103 F
#> 104 104 G
#> 105 105 S
#> 106 106 D
#> 107 107 D
#> 108 108 E
#> 109 109 E
#> 110 110 E
#> 111 111 S
#> 112 112 E
#> 113 113 E
#> 114 114 A
#> 115 115 K
#> 116 116 R
#> 117 117 L
#> 118 118 R
#> 119 119 E
#> 120 120 E
#> 121 121 R
#> 122 122 L
#> 123 123 A
#> 124 124 Q
#> 125 125 Y
#> 126 126 E
#> 127 127 S
#> 128 128 K
#> 129 129 K
#> 130 130 A
#> 131 131 K
#> 132 132 K
#> 133 133 P
#> 134 134 A
#> 135 135 L
#> 136 136 V
#> 137 137 A
#> 138 138 K
#> 139 139 S
#> 140 140 S
#> 141 141 I
#> 142 142 L
#> 143 143 L
#> 144 144 D
#> 145 145 V
#> 146 146 K
#> 147 147 P
#> 148 148 W
#> 149 149 D
#> 150 150 D
#> 151 151 E
#> 152 152 T
#> 153 153 D
#> 154 154 M
#> 155 155 A
#> 156 156 K
#> 157 157 L
#> 158 158 E
#> 159 159 E
#> 160 160 C
#> 161 161 V
#> 162 162 R
#> 163 163 S
#> 164 164 I
#> 165 165 Q
#> 166 166 A
#> 167 167 D
#> 168 168 G
#> 169 169 L
#> 170 170 V
#> 171 171 W
#> 172 172 G
#> 173 173 S
#> 174 174 S
#> 175 175 K
#> 176 176 L
#> 177 177 V
#> 178 178 P
#> 179 179 V
#> 180 180 G
#> 181 181 Y
#> 182 182 G
#> 183 183 I
#> 184 184 K
#> 185 185 K
#> 186 186 L
#> 187 187 Q
#> 188 188 I
#> 189 189 Q
#> 190 190 C
#> 191 191 V
#> 192 192 V
#> 193 193 E
#> 194 194 D
#> 195 195 D
#> 196 196 K
#> 197 197 V
#> 198 198 G
#> 199 199 T
#> 200 200 D
#> 201 201 M
#> 202 202 L
#> 203 203 E
#> 204 204 E
#> 205 205 Q
#> 206 206 I
#> 207 207 T
#> 208 208 A
#> 209 209 F
#> 210 210 E
#> 211 211 D
#> 212 212 Y
#> 213 213 V
#> 214 214 Q
#> 215 215 S
#> 216 216 M
#> 217 217 D
#> 218 218 V
#> 219 219 A
#> 220 220 A
#> 221 221 F